熊旭深
获奖者
本源青年PI助研金2024
浙江大学良渚实验室和浙江大学医学院附属第二医院
基于计算生物与人工智能的多基因遗传病机制解析
简介
本科毕业于华中科技大学，博士毕业于北京大学，2019至2022在MIT计算机与人工智能系进行博士后训练。2022年底入职浙江大学良渚实验室和浙江大学医学院附属第二医院，任研究员、博士生导师。
实验室主要研究方向为利用统计遗传、人工智能、实验生物学等多学科交叉的手段探究表观转录组和表观基因组在人类多基因遗传病中发挥作用的生物学机制，为多基因遗传病的预测、分子诊断和治疗提供了多个层次的分子靶点。以通讯作者或者第一作者身份（含共同）在Cell、Nature Genetics（2篇）、Nature Machine Intelligence、Cell Genomics等期刊发表论文多篇。
Selected Publications
1. Jialin He#, Lei Xiong#,*, Shaohui Shi, Chengyu Li, Kexuan Chen, Qianchen Fang, Jiuhong Nan, Ke Ding, Yuanhui Mao, Carles A. Boix, Xinyang Hu, Manolis Kellis, Jingyun Li, Xushen Xiong*. Deep learning modeling of ribosome profiling reveals regulatory underpinnings of translatome and interprets disease variants. Nature Machine Intelligence (2024)
2. Chengyu Li#, Kexuan Chen#, Qianchen Fang, Shaohui Shi, Jiuhong Nan, Jialin He, Yafei Yin, Xiaoyu Li, Jingyun Li, Lei Hou, Xikun Han*, Xushen Xiong*. Crosstalk between epitranscriptomic and epigenomic modifications and its implication in human diseases. Cell Genomics (2024)
3. Xushen Xiong#, Benjamin T. James#, Carles A. Boix#, Yongjin Park, Kyriaki Galani, Na Sun, Lei Hou, Li-Lun Ho, Julio Mantero, Hansruedi Mathys, David A. Bennett, Li-Huei Tsai, Manolis Kellis. Single-cell epigenomic dissection of Alzheimer's disease pinpoints causal genetic variants and reveals epigenome erosion. Cell (2023)
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